上樣緩沖液是一個較為寬泛的概念,用于在電泳實驗中輔助樣品上樣;而 SDS - PAGE 變性蛋白上樣緩沖液是針對 SDS - PAGE 電泳中蛋白質樣品設計的專用上樣緩沖液,二者在組成、作用和適用范圍上存在明顯區別:
組成成分
上樣緩沖液:一般包含甘油或蔗糖等密度調節劑,用于增加樣品密度,使樣品能沉入加樣孔,防止樣品在電泳緩沖液中擴散;還含有溴酚藍、二甲苯青 FF 等指示劑,便于觀察電泳進程。但不同類型的電泳,其基礎上樣緩沖液成分可能有所差異,一些簡單的核酸電泳上樣緩沖液可能僅由甘油和指示劑組成 。
SDS - PAGE 變性蛋白上樣緩沖液:除了含有甘油和溴酚藍,還包含 SDS 和 β - 巰基乙醇(或二硫蘇糖醇 DTT)等特殊成分。SDS 是陰離子去污劑,能使蛋白質變性并帶上大量負電荷;β - 巰基乙醇或 DTT 作為強還原劑,可切斷蛋白質中的二硫鍵,讓蛋白質充分伸展為線性分子,此外還含有 Tris - HCl 緩沖體系維持 pH 穩定。
作用機制
上樣緩沖液:主要作用是輔助樣品在電泳加樣時能準確進入加樣孔,并通過指示劑遷移大致判斷電泳進度,對樣品本身的結構和性質通常沒有明顯改變(如在核酸電泳中,不會使核酸變性)。
SDS - PAGE 變性蛋白上樣緩沖液:不僅具備上樣緩沖液的基本功能,更重要的是使蛋白質變性。通過 SDS 與蛋白質結合、β - 巰基乙醇或 DTT 破壞二硫鍵,消除蛋白質的電荷和空間結構差異,使蛋白質僅依據分子量大小在電泳中分離,為后續分析蛋白質分子量、純度等提供基礎。
適用范圍